Ưu đãi với doanh nghiệp chế xuất ( EPE ) năm 2025

Doanh nghiệp chế xuất là loại hình doanh nghiệp chuyên sản xuất hàng hóa để xuất khẩu ra nước ngoài, thường được đặt trong khu chế xuất – một khu vực đặc biệt được hưởng các cơ chế ưu đãi về thuế, hải quan và đầu tư.

Ưu đãi doanh nghiệp chế xuất năm 2025
Ưu đãi doanh nghiệp chế xuất năm 2025

Vậy doanh nghiệp chế xuất được hưởng những chính sách ưu đãi nào từ Nhà nước? Cùng Kế Toán Trust điểm qua 5 nhóm ưu đãi quan trọng và phần so sánh giữa doanh nghiệp EPE và doanh nghiệp thường để hiểu rõ hơn.

Ưu đãi về đầu tư và chính sách thuế

Theo khoản 3 Điều 26 Nghị định số 35/2022/NĐ-CP, doanh nghiệp chế xuất khi được thành lập tại khu phi thuế quan sẽ được hưởng các ưu đãi đầu tư ngay từ thời điểm thành lập, cụ thể là:

Tính từ khi mục tiêu đầu tư được ghi nhận tại:

  • Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư
  • Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư điều chỉnh
  • Hoặc Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp

Doanh nghiệp chế xuất sau khi xây dựng xong còn cần được cơ quan hải quan xác nhận đủ điều kiện kiểm tra, giám sát hải quan, để chính thức được hoạt động trong chế độ ưu đãi thuế xuất – nhập khẩu.

Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN)

Doanh nghiệp chế xuất thường được xếp vào nhóm dự án ưu đãi đầu tư theo Phụ lục II Nghị định 31/2021/NĐ-CP. Nhờ đó:

Áp dụng thuế suất TNDN ưu đãi 20% trong 10 năm nếu đặt tại địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội khó khăn (theo Thông tư 78/2014/TT-BTC).

Được miễn thuế 2 năm đầu, giảm 50% trong 4 năm tiếp theo đối với thu nhập từ dự án đầu tư mới (theo Thông tư 151/2014/TT-BTC).

👉 Đây là một lợi thế cạnh tranh rõ ràng về chi phí thuế cho các doanh nghiệp định hướng xuất khẩu.

Ưu đãi thuế giá trị gia tăng (GTGT)

Theo khoản 20 Điều 4 Thông tư 219/2013/TT-BTC:

“Khu phi thuế quan bao gồm khu chế xuất, doanh nghiệp chế xuất… là đối tượng không chịu thuế GTGT. Giao dịch giữa các khu này với bên ngoài được xem là xuất nhập khẩu.”

Tức là:

✅ Khi doanh nghiệp chế xuất mua bán hàng hóa với nội địa hoặc nước ngoài đều được tính theo hình thức xuất khẩu/nhập khẩu, không phải nộp thuế GTGT như doanh nghiệp thường.

Ưu đãi thuế xuất khẩu – nhập khẩu

Theo Điều 4 Luật Thuế xuất, nhập khẩu 2016 và hướng dẫn tại Thông tư 219/2013/TT-BTC, doanh nghiệp chế xuất thuộc khu phi thuế quan nên được miễn thuế xuất – nhập khẩu đối với các trường hợp sau:

  • Xuất khẩu từ khu chế xuất ra nước ngoài
  • Nhập khẩu từ nước ngoài vào khu chế xuất, chỉ sử dụng trong khu này
  • Hàng hóa chuyển giữa các khu chế xuất

Đây là ưu đãi quan trọng giúp doanh nghiệp tối ưu chi phí nguyên vật liệu, máy móc nhập khẩu phục vụ sản xuất.

Ưu đãi về tiền thuê đất

Theo điểm b khoản 3 Điều 19 Nghị định 46/2014/NĐ-CP:

Nếu doanh nghiệp chế xuất đầu tư tại địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội khó khăn, sẽ được:

👉 Miễn tiền thuê đất thêm 07 năm sau thời gian miễn cho giai đoạn xây dựng cơ bản.

Chính sách này giúp giảm đáng kể chi phí cố định, đặc biệt với các dự án sản xuất quy mô lớn cần diện tích nhà xưởng.

Khác biệt giữa doanh nghiệp chế xuất và doanh nghiệp thông thường

Tiêu chí Doanh nghiệp chế xuất Doanh nghiệp thông thường
Thủ tục hải quan khi bán vào khu chế xuất Có thể làm hoặc không làm Bắt buộc làm
Thuế tiêu dùng khi bán vào khu chế xuất Không chịu Phải chịu
Bán hàng vào nội địa Bắt buộc làm thủ tục hải quan, cần giấy phép phân phối Không cần làm thủ tục hải quan
Mua hàng từ nội địa Bắt buộc làm thủ tục hải quan (trừ một số loại hàng tiêu dùng, thực phẩm…) Không làm thủ tục hải quan
Thuế GTGT khi mua hàng từ khu chế xuất Không chịu Phải nộp thuế
Dịch vụ cung cấp cho nội địa Không làm thủ tục hải quan, kê khai thuế như doanh nghiệp thường Không làm thủ tục hải quan, kê khai theo chế độ nội địa
Sử dụng ngoại tệ trong giao dịch Không sử dụng (trừ khi mua hàng từ nội địa) Không sử dụng (trừ khi bán cho DN chế xuất)

📌 Lưu ý: Doanh nghiệp chế xuất bị kiểm soát chặt hơn về quy trình hải quan, báo cáo, nhưng đổi lại được hưởng rất nhiều ưu đãi giúp giảm thiểu chi phí.

Doanh nghiệp chế xuất là mô hình phù hợp cho những doanh nghiệp định hướng xuất khẩu hoặc tham gia chuỗi cung ứng toàn cầu. Với các ưu đãi mạnh về thuế, đất đai, chính sách hải quan, mô hình này không chỉ giúp doanh nghiệp tiết kiệm chi phí mà còn dễ dàng thu hút vốn đầu tư và hợp tác quốc tế.

Nếu bạn đang có kế hoạch thành lập doanh nghiệp chế xuất hoặc cần tư vấn về chính sách thuế, Kế Toán Trust sẵn sàng đồng hành và hỗ trợ tận tâm.